I believe item 1 and 2 should be included in the annual gross income. Unless they're being stated clearly that it is being tax exempted.

Perkuisit sama ada dalam bentuk tunai atau barangan berkaitan dengan
penggajian pekerja berhubung dengan:-
(a)  pencapaian perkhidmatan lalu; 
(b) anugerah khidmat cemerlang, anugerah inovasi atau anugerah
produktiviti; atau
© perkhidmatan lama dengan syarat pekerja tersebut telah berkhidmat
lebih daripada 10 tahun dengan majikan yang sama atau dengan
syarikat-syarikat dalam kumpulan syarikat yang sama.
(Perenggan 25C Jadual 6 Akta Cukai Pendapatan 1967)

That's why I mentioned earlier. If your company reports them under Section B Pendapatan Penggajian, Manfaat Dan Tempat Kediaman, then it's not tax exempted.

If your company reports them under Section G Jumlah Elaun/Perkuisit/Manfaact Yang Dikecualikan Cukai, then you're absolutely correct.