Yeah, another confirmation from Japan Ministry of Foreign Affairs:

"7月1日から，短期滞在を目的とするマレーシア国民であって，IC一般旅券を所持する者に対し，上述のビザ取得の勧奨を終了し，ビザを取得することなく我が国への入国を可能とすることにより，短期滞在目的のビザ免除措置を実質的に再開することとしました。"

http://www.mofa.go.jp/mofaj/press/release/press6_000362.html